Новости

Oct 07, 2023

Геномы шести вирусов, поражающих архей Асгарда из глубин

Природная микробиология, том 7,

Природная микробиология, том 7, страницы 953–961 (2022 г.) Процитировать эту статью

7872 Доступа

10 цитат

433 Альтметрика

Подробности о метриках

Асгардские археи — глобально распространенные прокариотические микроорганизмы, родственные эукариотам; однако вирусы, поражающие эти организмы, не описаны. Здесь, используя метагеномные последовательности, извлеченные из глубоководных гидротермальных отложений, мы охарактеризовали шесть относительно крупных (до 117 т.п.н.) вирусных геномов с двухцепочечной ДНК (дцДНК), которые инфицировали два типа архей Асгарда, Lokiarchaeota и Helarchaeota. Эти вирусы кодируют структурные белки, подобные Caudovirales, а также белки, отличные от белков, описанных у известных архейных вирусов. Их геномы содержат около 1–5% генов, связанных с эукариотическими нуклеоцитоплазматическими большими ДНК-вирусами (NCLDV), и, по-видимому, способны к полуавтономной репликации, репарации генома, эпигенетическим модификациям и регуляции транскрипции. Более того, вирусы Helarchaeota могут захватывать убиквитиновые системы хозяина, подобно эукариотическим вирусам. Геномный анализ этих вирусов Асгарда показывает, что они содержат черты как прокариотических, так и эукариотических вирусов, и дает представление об их потенциальном заражении и механизмах взаимодействия с хозяином.

Это предварительный просмотр контента подписки, доступ через ваше учреждение.

Статьи в открытом доступе, цитирующие эту статью.

Nature Communications Открытый доступ 29 декабря 2022 г.

Природная микробиология Открытый доступ 27 июня 2022 г.

Доступ к журналу Nature и 54 другим журналам Nature Portfolio.

Приобретите Nature+, нашу выгодную подписку с онлайн-доступом.

29,99 долларов США / 30 дней

отменить в любое время

Подпишитесь на этот журнал

Получите 12 цифровых выпусков и онлайн-доступ к статьям.

119,00 долларов США в год

всего $9,92 за выпуск

Возьмите напрокат или купите эту статью

Получите только эту статью до тех пор, пока она вам нужна

$39,95

Цены могут зависеть от местных налогов, которые рассчитываются во время оформления заказа.

Геномные последовательности, связанные с исследованием, были депонированы в NCBI под названием BioProject PRJNA692327.

Все пользовательские сценарии, выравнивания и файлы филогенетического дерева доступны по адресу https://github.com/bakermicrolab/asgardviruses.

Спанг, А. и др. Сложные археи, заполняющие пропасть между прокариотами и эукариотами. Природа 521, 173–179 (2015).

Статья CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Заремба-Недзведска, К. и др. Асгардские археи освещают происхождение сложности эукариотических клеток. Природа 541, 353–358 (2017).

Статья CAS PubMed Google Scholar

Эме Л., Спанг А., Ломбард Дж., Стэйрс К.В. и Эттема Т.Дж. Археи и происхождение эукариот. Нат. Преподобный Микробиол. 15, 711–723 (2017).

Статья CAS PubMed Google Scholar

Бейкер, Б.Дж. и др. Разнообразие, экология и эволюция архей. Нат. Микробиол. 5, 887–900 (2020).

Статья CAS PubMed Google Scholar

Имачи, Х. и др. Выделение археи на границе прокариот-эукариот. Природа 577, 519–525 (2020).

Статья CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Спанг, А. и др. Предложение модели обратного потока происхождения эукариотической клетки на основе сравнительного анализа метаболизма архей Асгарда. Нат. Микробиол. 4, 1138–1148 (2019).

Статья CAS PubMed Google Scholar

Белл, П.Дж.Л. Доказательства, подтверждающие вирусное происхождение эукариотического ядра. Вирус Рез. 289, 198168 (2020).